Το Ιωακείμειο Γηροκομείο διοικείται από πενταμελές Διοικητικό Συμβούλιο με Πρόεδρο τον εκάστοτε Μητροπολίτη Αλεξανδρουπόλεως. Η τρέχουσα σύνθεση του Δ.Σ. (2023-25) είναι η εξής: 

Μητροπολίτης Άνθιμος, Πρόεδρος Δ.Σ.
Στέλλα Ιωαννίδου, τ. Διευθύνουσα Νοσηλευτικού Προσωπικού Π.Γ.Ν.Α.
Μιχαήλ Κογιομτζής, τ. Αντινομάρχης Έβρου
Αλέξανδρος Πολυχρονίδης, τ. Πρύτανης Δ.Π.Θ.-Καθηγητής Χειρουργικής
Ιωάννης Χρυσόπουλος, Αρχιτέκτονας

Διευθυντής: Αρχιμ. Χριστόδουλος Καραθανάσης